प्रशासन विभागाकडून खालील विषय हाताळले जातात :-
- राज्यपाल सचिव कार्यालयाच्या आस्थापनाविषयक बाबी.
- अधिनियम व संविधानिक विषयावरील प्रकरणे.
- अध्यादेशाचे प्रख्यापन
- राज्यविधानमंडळाची अधिवेशने अभिनिमंत्रित व संस्थगित करणे.
- जन्मठेप व मृत्युदंडाची शिक्षा झालेल्या बंदयांच्या दया याचिका.
- शासनाच्या विविध विभागातील पदांचे सेवाप्रवेश नियम.
- विधीमंडळ सदस्यांची अनर्हतेबाबतची व लोक सेवकांवर खटला दाखल करण्याबाबतची प्रकरणे.
- महाराष्ट्र नागरी सेवा (शिस्त व अपील) नियम, १९७९ मधील नियम १८(१) व २५/२५ (अ) अंतर्गत शासकीय कर्मचाऱ्यांचे पुनर्विलाकन अर्ज.
- महाराष्ट्र लोकसेवा आयोग व लोकायुक्त यांचे वार्षिक अहवाल.
- राष्ट्रपतींचे पोलीस पदक शिफारशी
- राष्ट्रपतींचे होमगार्ड व अग्निशमन सेवा पदक शिफारशी.
- जनतेच्या तक्रारी.
- विविध सामाजिक संस्थांकडून मा. राज्यपालांना आश्रयदाते होण्यासाठी निमंत्रणे.
- राज्यपाल सचिव कार्यालयाच्या प्रशासकीय बाबी.